土地确权纠纷处理部门有哪些

土地确权纠纷主要由县级以上人民政府土地管理部门或乡级人民政府处理。法律依据：《土地管理法》第十六条，土地所有权和使用权争议，由当事人协商解决；协商不成的，由人民政府处理。未及时处理的，可能影响土地利用，并给土地承包经营造成较大损失的，可处以罚款等处罚。不及时处理可能导致土地利用混乱，影响土地承包经营，甚至产生更大纠纷或损失。
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常见的处理方式包括：首先向相关部门提出书面申请，双方当事人出示证据，接受政府工作人员的调查取证，参与调解并达成书面调解书，如调解无果则政府将及时提出处理意见。选择处理方式时，应考虑效率和公平性，先尝试协商解决，不行再申请政府介入调解，并确保遵守所有程序要求。
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不同情况处理方式：1. 如纠纷涉及土地使用权，需明确产权并出示相关证据。2. 若双方对土地界限有争议，需现场勘查并确定界限。3. 对调解不服或反悔，土地管理部门将提出处理意见，并可能上报人民政府作出处理决定。4. 如涉及违法行为，将依据《土地管理法》进行相应处罚。